Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWC9

Gm3558, Predicted gene 3558, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3558Q5FWC9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3558Q5FWC9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3558Q5FWC9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3558Q5FWC9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3558Q5FWC9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3558Q5FWC9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3558Q5FWC9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3558Q5FWC9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3558Q5FWC9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3558Q5FWC9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3558Q5FWC9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3558Q5FWC9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3558Q5FWC9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3558Q5FWC9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3558Q5FWC9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3558Q5FWC9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3558Q5FWC9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3558Q5FWC9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm3558Q5FWC9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm3558Q5FWC9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3558Q5FWC9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3558Q5FWC9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3558Q5FWC9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3558Q5FWC9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3558Q5FWC9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3558Q5FWC9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3558Q5FWC9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3558Q5FWC9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3558Q5FWC9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3558Q5FWC9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3558Q5FWC9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3558Q5FWC9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3558Q5FWC9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3558Q5FWC9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3558Q5FWC9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3558Q5FWC9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3558Q5FWC9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3558Q5FWC9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3558Q5FWC9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3558Q5FWC9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3558Q5FWC9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3558Q5FWC9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3558Q5FWC9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Gm3558Q5FWC9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3558Q5FWC9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3558Q5FWC9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Gm3558Q5FWC9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Gm3558Q5FWC9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Gm3558Q5FWC9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Gm3558Q5FWC9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3558Q5FWC9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3558Q5FWC9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3558Q5FWC9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3558Q5FWC9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3558Q5FWC9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3558Q5FWC9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3558Q5FWC9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3558Q5FWC9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3558Q5FWC9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3558Q5FWC9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3558Q5FWC9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3558Q5FWC9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm3558Q5FWC9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3558Q5FWC9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3558Q5FWC9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3558Q5FWC9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3558Q5FWC9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3558Q5FWC9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3558Q5FWC9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3558Q5FWC9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm3558Q5FWC9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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