Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Prkaa1Q5EG47 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prkaa1Q5EG47 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms