Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rtl5Q5DTT4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rtl5Q5DTT4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rtl5Q5DTT4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rtl5Q5DTT4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rtl5Q5DTT4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Rtl5Q5DTT4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rtl5Q5DTT4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rtl5Q5DTT4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Rtl5Q5DTT4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rtl5Q5DTT4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rtl5Q5DTT4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rtl5Q5DTT4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rtl5Q5DTT4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rtl5Q5DTT4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rtl5Q5DTT4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rtl5Q5DTT4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rtl5Q5DTT4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rtl5Q5DTT4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rtl5Q5DTT4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rtl5Q5DTT4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rtl5Q5DTT4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Rtl5Q5DTT4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rtl5Q5DTT4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rtl5Q5DTT4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rtl5Q5DTT4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rtl5Q5DTT4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rtl5Q5DTT4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rtl5Q5DTT4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rtl5Q5DTT4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rtl5Q5DTT4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rtl5Q5DTT4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rtl5Q5DTT4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rtl5Q5DTT4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rtl5Q5DTT4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rtl5Q5DTT4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rtl5Q5DTT4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Rtl5Q5DTT4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rtl5Q5DTT4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rtl5Q5DTT4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rtl5Q5DTT4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rtl5Q5DTT4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Rtl5Q5DTT4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rtl5Q5DTT4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rtl5Q5DTT4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rtl5Q5DTT4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rtl5Q5DTT4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rtl5Q5DTT4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rtl5Q5DTT4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Rtl5Q5DTT4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rtl5Q5DTT4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rtl5Q5DTT4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rtl5Q5DTT4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rtl5Q5DTT4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Rtl5Q5DTT4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rtl5Q5DTT4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rtl5Q5DTT4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Rtl5Q5DTT4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rtl5Q5DTT4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rtl5Q5DTT4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rtl5Q5DTT4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rtl5Q5DTT4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rtl5Q5DTT4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms