Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Fam208bQ5DTT3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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