Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR3

Prune2, Protein prune homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune2Q52KR3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prune2Q52KR3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prune2Q52KR3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms