Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccnl1Q52KE7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccnl1Q52KE7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccnl1Q52KE7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccnl1Q52KE7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccnl1Q52KE7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccnl1Q52KE7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccnl1Q52KE7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccnl1Q52KE7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccnl1Q52KE7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccnl1Q52KE7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms