Protein–RNA interactions for Protein: Q499E6

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q499E6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
C1orf109Q499E6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf109Q499E6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf109Q499E6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf109Q499E6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf109Q499E6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf109Q499E6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf109Q499E6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf109Q499E6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf109Q499E6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf109Q499E6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf109Q499E6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf109Q499E6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf109Q499E6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf109Q499E6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf109Q499E6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf109Q499E6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf109Q499E6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf109Q499E6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf109Q499E6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf109Q499E6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf109Q499E6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf109Q499E6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf109Q499E6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf109Q499E6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C1orf109Q499E6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf109Q499E6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf109Q499E6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf109Q499E6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf109Q499E6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf109Q499E6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf109Q499E6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf109Q499E6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf109Q499E6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf109Q499E6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf109Q499E6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf109Q499E6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf109Q499E6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf109Q499E6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf109Q499E6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf109Q499E6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf109Q499E6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf109Q499E6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C1orf109Q499E6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms