Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2D6

Krtap1-4, Keratin-associated protein 1-4, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap1-4Q3V2D6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Krtap1-4Q3V2D6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms