Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Usp48Q3V0C5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp48Q3V0C5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms