Protein–RNA interactions for Protein: Q3V063

4933416C03Rik, MCG64776, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933416C03RikQ3V063 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4933416C03RikQ3V063 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC21.32■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.32■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
4933416C03RikQ3V063 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms