Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ttc9Q3V038 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc9Q3V038 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms