Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnpc3Q3UZ01 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnpc3Q3UZ01 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnpc3Q3UZ01 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnpc3Q3UZ01 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnpc3Q3UZ01 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnpc3Q3UZ01 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnpc3Q3UZ01 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnpc3Q3UZ01 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnpc3Q3UZ01 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnpc3Q3UZ01 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnpc3Q3UZ01 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnpc3Q3UZ01 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnpc3Q3UZ01 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnpc3Q3UZ01 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnpc3Q3UZ01 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnpc3Q3UZ01 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnpc3Q3UZ01 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnpc3Q3UZ01 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnpc3Q3UZ01 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnpc3Q3UZ01 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnpc3Q3UZ01 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnpc3Q3UZ01 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnpc3Q3UZ01 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnpc3Q3UZ01 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnpc3Q3UZ01 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnpc3Q3UZ01 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnpc3Q3UZ01 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnpc3Q3UZ01 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnpc3Q3UZ01 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnpc3Q3UZ01 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnpc3Q3UZ01 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnpc3Q3UZ01 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnpc3Q3UZ01 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnpc3Q3UZ01 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnpc3Q3UZ01 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnpc3Q3UZ01 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnpc3Q3UZ01 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnpc3Q3UZ01 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnpc3Q3UZ01 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnpc3Q3UZ01 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnpc3Q3UZ01 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rnpc3Q3UZ01 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnpc3Q3UZ01 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnpc3Q3UZ01 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnpc3Q3UZ01 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnpc3Q3UZ01 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnpc3Q3UZ01 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnpc3Q3UZ01 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnpc3Q3UZ01 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnpc3Q3UZ01 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnpc3Q3UZ01 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnpc3Q3UZ01 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rnpc3Q3UZ01 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rnpc3Q3UZ01 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rnpc3Q3UZ01 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rnpc3Q3UZ01 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnpc3Q3UZ01 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnpc3Q3UZ01 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnpc3Q3UZ01 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnpc3Q3UZ01 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnpc3Q3UZ01 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnpc3Q3UZ01 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnpc3Q3UZ01 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnpc3Q3UZ01 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnpc3Q3UZ01 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnpc3Q3UZ01 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnpc3Q3UZ01 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnpc3Q3UZ01 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnpc3Q3UZ01 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnpc3Q3UZ01 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnpc3Q3UZ01 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnpc3Q3UZ01 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rnpc3Q3UZ01 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnpc3Q3UZ01 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnpc3Q3UZ01 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnpc3Q3UZ01 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnpc3Q3UZ01 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnpc3Q3UZ01 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnpc3Q3UZ01 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnpc3Q3UZ01 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnpc3Q3UZ01 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnpc3Q3UZ01 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnpc3Q3UZ01 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnpc3Q3UZ01 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnpc3Q3UZ01 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rnpc3Q3UZ01 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rnpc3Q3UZ01 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rnpc3Q3UZ01 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rnpc3Q3UZ01 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rnpc3Q3UZ01 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rnpc3Q3UZ01 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rnpc3Q3UZ01 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rnpc3Q3UZ01 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rnpc3Q3UZ01 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rnpc3Q3UZ01 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rnpc3Q3UZ01 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Rnpc3Q3UZ01 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rnpc3Q3UZ01 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Rnpc3Q3UZ01 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms