Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWZ0

Trim75, Tripartite motif-containing protein 75, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim75Q3UWZ0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim75Q3UWZ0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim75Q3UWZ0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim75Q3UWZ0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim75Q3UWZ0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim75Q3UWZ0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim75Q3UWZ0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim75Q3UWZ0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim75Q3UWZ0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim75Q3UWZ0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim75Q3UWZ0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim75Q3UWZ0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim75Q3UWZ0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim75Q3UWZ0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim75Q3UWZ0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim75Q3UWZ0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim75Q3UWZ0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim75Q3UWZ0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim75Q3UWZ0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim75Q3UWZ0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim75Q3UWZ0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim75Q3UWZ0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim75Q3UWZ0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim75Q3UWZ0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim75Q3UWZ0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim75Q3UWZ0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim75Q3UWZ0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim75Q3UWZ0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim75Q3UWZ0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim75Q3UWZ0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim75Q3UWZ0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim75Q3UWZ0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim75Q3UWZ0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim75Q3UWZ0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim75Q3UWZ0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim75Q3UWZ0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim75Q3UWZ0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim75Q3UWZ0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim75Q3UWZ0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim75Q3UWZ0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim75Q3UWZ0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim75Q3UWZ0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim75Q3UWZ0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim75Q3UWZ0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim75Q3UWZ0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim75Q3UWZ0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim75Q3UWZ0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim75Q3UWZ0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim75Q3UWZ0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim75Q3UWZ0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim75Q3UWZ0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim75Q3UWZ0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim75Q3UWZ0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim75Q3UWZ0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim75Q3UWZ0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim75Q3UWZ0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim75Q3UWZ0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim75Q3UWZ0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim75Q3UWZ0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim75Q3UWZ0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim75Q3UWZ0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim75Q3UWZ0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trim75Q3UWZ0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trim75Q3UWZ0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trim75Q3UWZ0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trim75Q3UWZ0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trim75Q3UWZ0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim75Q3UWZ0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim75Q3UWZ0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim75Q3UWZ0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim75Q3UWZ0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim75Q3UWZ0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim75Q3UWZ0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim75Q3UWZ0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim75Q3UWZ0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim75Q3UWZ0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim75Q3UWZ0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim75Q3UWZ0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim75Q3UWZ0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trim75Q3UWZ0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim75Q3UWZ0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim75Q3UWZ0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim75Q3UWZ0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim75Q3UWZ0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim75Q3UWZ0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim75Q3UWZ0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim75Q3UWZ0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim75Q3UWZ0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim75Q3UWZ0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim75Q3UWZ0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim75Q3UWZ0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim75Q3UWZ0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim75Q3UWZ0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim75Q3UWZ0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim75Q3UWZ0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim75Q3UWZ0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim75Q3UWZ0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim75Q3UWZ0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trim75Q3UWZ0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trim75Q3UWZ0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms