Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW21

Clpsl2, Colipase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clpsl2Q3UW21 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clpsl2Q3UW21 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Clpsl2Q3UW21 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms