Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
D130052B06RikQ3UW13 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms