Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chpf2Q3UU43 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chpf2Q3UU43 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chpf2Q3UU43 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chpf2Q3UU43 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chpf2Q3UU43 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Chpf2Q3UU43 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chpf2Q3UU43 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chpf2Q3UU43 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chpf2Q3UU43 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chpf2Q3UU43 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chpf2Q3UU43 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chpf2Q3UU43 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chpf2Q3UU43 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chpf2Q3UU43 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chpf2Q3UU43 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chpf2Q3UU43 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chpf2Q3UU43 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chpf2Q3UU43 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Chpf2Q3UU43 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chpf2Q3UU43 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chpf2Q3UU43 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Chpf2Q3UU43 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chpf2Q3UU43 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chpf2Q3UU43 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Chpf2Q3UU43 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chpf2Q3UU43 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Chpf2Q3UU43 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Chpf2Q3UU43 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms