Protein–RNA interactions for Protein: Q3USZ8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3USZ8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3USZ8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3USZ8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3USZ8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3USZ8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q3USZ8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3USZ8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3USZ8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3USZ8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3USZ8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3USZ8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3USZ8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3USZ8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3USZ8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3USZ8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3USZ8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3USZ8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3USZ8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3USZ8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3USZ8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3USZ8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q3USZ8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3USZ8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3USZ8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3USZ8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3USZ8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3USZ8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3USZ8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3USZ8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3USZ8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3USZ8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3USZ8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3USZ8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3USZ8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3USZ8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3USZ8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3USZ8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3USZ8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Q3USZ8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3USZ8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3USZ8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3USZ8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3USZ8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3USZ8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3USZ8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3USZ8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3USZ8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3USZ8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3USZ8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3USZ8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3USZ8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3USZ8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3USZ8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3USZ8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3USZ8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3USZ8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3USZ8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3USZ8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3USZ8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3USZ8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3USZ8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3USZ8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3USZ8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3USZ8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3USZ8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3USZ8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3USZ8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3USZ8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3USZ8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3USZ8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3USZ8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3USZ8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3USZ8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3USZ8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3USZ8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3USZ8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3USZ8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3USZ8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3USZ8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3USZ8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3USZ8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3USZ8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3USZ8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3USZ8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3USZ8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3USZ8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3USZ8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3USZ8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3USZ8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3USZ8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3USZ8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3USZ8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3USZ8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3USZ8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3USZ8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3USZ8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3USZ8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3USZ8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3USZ8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3USZ8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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