Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm6899Q3USS0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm6899Q3USS0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm6899Q3USS0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm6899Q3USS0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm6899Q3USS0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Gm6899Q3USS0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm6899Q3USS0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm6899Q3USS0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm6899Q3USS0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm6899Q3USS0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm6899Q3USS0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm6899Q3USS0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm6899Q3USS0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm6899Q3USS0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm6899Q3USS0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6899Q3USS0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6899Q3USS0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm6899Q3USS0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Gm6899Q3USS0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6899Q3USS0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6899Q3USS0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6899Q3USS0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6899Q3USS0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Gm6899Q3USS0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Gm6899Q3USS0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm6899Q3USS0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Gm6899Q3USS0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6899Q3USS0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Gm6899Q3USS0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Gm6899Q3USS0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6899Q3USS0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6899Q3USS0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6899Q3USS0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6899Q3USS0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6899Q3USS0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6899Q3USS0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6899Q3USS0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm6899Q3USS0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm6899Q3USS0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm6899Q3USS0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm6899Q3USS0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm6899Q3USS0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm6899Q3USS0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6899Q3USS0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6899Q3USS0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm6899Q3USS0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6899Q3USS0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6899Q3USS0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm6899Q3USS0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6899Q3USS0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm6899Q3USS0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
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