Protein–RNA interactions for Protein: Q3UR50

Vwa5b2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa5b2Q3UR50 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Vwa5b2Q3UR50 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vwa5b2Q3UR50 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vwa5b2Q3UR50 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vwa5b2Q3UR50 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vwa5b2Q3UR50 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vwa5b2Q3UR50 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vwa5b2Q3UR50 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vwa5b2Q3UR50 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vwa5b2Q3UR50 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vwa5b2Q3UR50 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vwa5b2Q3UR50 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vwa5b2Q3UR50 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vwa5b2Q3UR50 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vwa5b2Q3UR50 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vwa5b2Q3UR50 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vwa5b2Q3UR50 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vwa5b2Q3UR50 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vwa5b2Q3UR50 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vwa5b2Q3UR50 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vwa5b2Q3UR50 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vwa5b2Q3UR50 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vwa5b2Q3UR50 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vwa5b2Q3UR50 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vwa5b2Q3UR50 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vwa5b2Q3UR50 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vwa5b2Q3UR50 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vwa5b2Q3UR50 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vwa5b2Q3UR50 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vwa5b2Q3UR50 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vwa5b2Q3UR50 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vwa5b2Q3UR50 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vwa5b2Q3UR50 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vwa5b2Q3UR50 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vwa5b2Q3UR50 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vwa5b2Q3UR50 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vwa5b2Q3UR50 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vwa5b2Q3UR50 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vwa5b2Q3UR50 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vwa5b2Q3UR50 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vwa5b2Q3UR50 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vwa5b2Q3UR50 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vwa5b2Q3UR50 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vwa5b2Q3UR50 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vwa5b2Q3UR50 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vwa5b2Q3UR50 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vwa5b2Q3UR50 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vwa5b2Q3UR50 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vwa5b2Q3UR50 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vwa5b2Q3UR50 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vwa5b2Q3UR50 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vwa5b2Q3UR50 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vwa5b2Q3UR50 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vwa5b2Q3UR50 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vwa5b2Q3UR50 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vwa5b2Q3UR50 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms