Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Nhlrc4Q3UP44 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nhlrc4Q3UP44 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms