Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nlrc4Q3UP24 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrc4Q3UP24 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms