Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hdgfl2Q3UMU9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms