Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc33Q3ULW6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc33Q3ULW6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc33Q3ULW6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc33Q3ULW6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc33Q3ULW6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc33Q3ULW6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc33Q3ULW6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc33Q3ULW6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc33Q3ULW6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc33Q3ULW6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc33Q3ULW6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc33Q3ULW6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc33Q3ULW6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc33Q3ULW6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc33Q3ULW6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc33Q3ULW6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc33Q3ULW6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc33Q3ULW6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc33Q3ULW6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc33Q3ULW6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc33Q3ULW6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc33Q3ULW6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc33Q3ULW6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc33Q3ULW6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc33Q3ULW6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc33Q3ULW6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc33Q3ULW6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc33Q3ULW6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc33Q3ULW6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc33Q3ULW6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc33Q3ULW6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms