Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKJ7

Smu1, WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 513 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1Q3UKJ7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smu1Q3UKJ7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Smu1Q3UKJ7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smu1Q3UKJ7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smu1Q3UKJ7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smu1Q3UKJ7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smu1Q3UKJ7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smu1Q3UKJ7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smu1Q3UKJ7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smu1Q3UKJ7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smu1Q3UKJ7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smu1Q3UKJ7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smu1Q3UKJ7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smu1Q3UKJ7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smu1Q3UKJ7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smu1Q3UKJ7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smu1Q3UKJ7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smu1Q3UKJ7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smu1Q3UKJ7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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