Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc61Q3UJV1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc61Q3UJV1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms