Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sf3b2Q3UJB0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sf3b2Q3UJB0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms