Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Greb1Q3UHK3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Greb1Q3UHK3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms