Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC0

Tnrc6c, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6cQ3UHC0 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tnrc6cQ3UHC0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tnrc6cQ3UHC0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnrc6cQ3UHC0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnrc6cQ3UHC0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnrc6cQ3UHC0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tnrc6cQ3UHC0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms