Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGS4

Mcrip1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcrip1Q3UGS4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mcrip1Q3UGS4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mcrip1Q3UGS4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mcrip1Q3UGS4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mcrip1Q3UGS4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mcrip1Q3UGS4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mcrip1Q3UGS4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mcrip1Q3UGS4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mcrip1Q3UGS4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mcrip1Q3UGS4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mcrip1Q3UGS4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms