Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGK8

Gm5113, Predicted gene 5113, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5113Q3UGK8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5113Q3UGK8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms