Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY0

Rrp36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp36Q3UFY0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rrp36Q3UFY0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms