Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Puf60Q3UEB3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Puf60Q3UEB3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms