Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Yipf3Q3UDR8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Yipf3Q3UDR8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms