Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Parp8Q3UD82 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms