Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gse1Q3U3C9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gse1Q3U3C9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gse1Q3U3C9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gse1Q3U3C9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Gse1Q3U3C9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gse1Q3U3C9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gse1Q3U3C9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gse1Q3U3C9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gse1Q3U3C9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Gse1Q3U3C9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gse1Q3U3C9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gse1Q3U3C9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gse1Q3U3C9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gse1Q3U3C9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gse1Q3U3C9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gse1Q3U3C9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gse1Q3U3C9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gse1Q3U3C9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gse1Q3U3C9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gse1Q3U3C9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gse1Q3U3C9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gse1Q3U3C9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gse1Q3U3C9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gse1Q3U3C9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Gse1Q3U3C9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gse1Q3U3C9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Gse1Q3U3C9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gse1Q3U3C9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gse1Q3U3C9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gse1Q3U3C9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gse1Q3U3C9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gse1Q3U3C9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gse1Q3U3C9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gse1Q3U3C9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gse1Q3U3C9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gse1Q3U3C9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gse1Q3U3C9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gse1Q3U3C9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gse1Q3U3C9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gse1Q3U3C9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gse1Q3U3C9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gse1Q3U3C9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gse1Q3U3C9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gse1Q3U3C9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gse1Q3U3C9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gse1Q3U3C9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gse1Q3U3C9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gse1Q3U3C9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gse1Q3U3C9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gse1Q3U3C9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gse1Q3U3C9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gse1Q3U3C9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gse1Q3U3C9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms