Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hvcn1Q3U2S8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Hvcn1Q3U2S8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hvcn1Q3U2S8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hvcn1Q3U2S8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hvcn1Q3U2S8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hvcn1Q3U2S8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hvcn1Q3U2S8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hvcn1Q3U2S8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hvcn1Q3U2S8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hvcn1Q3U2S8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hvcn1Q3U2S8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hvcn1Q3U2S8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hvcn1Q3U2S8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hvcn1Q3U2S8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hvcn1Q3U2S8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hvcn1Q3U2S8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hvcn1Q3U2S8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hvcn1Q3U2S8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hvcn1Q3U2S8 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hvcn1Q3U2S8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hvcn1Q3U2S8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hvcn1Q3U2S8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hvcn1Q3U2S8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hvcn1Q3U2S8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hvcn1Q3U2S8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hvcn1Q3U2S8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hvcn1Q3U2S8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms