Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K0

Fam193b, Protein FAM193B, mousemouse

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam193bQ3U2K0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fam193bQ3U2K0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam193bQ3U2K0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms