Protein–RNA interactions for Protein: Q3U213

Serac1, Protein SERAC1, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serac1Q3U213 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Serac1Q3U213 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Serac1Q3U213 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Serac1Q3U213 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Serac1Q3U213 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Serac1Q3U213 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Serac1Q3U213 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Serac1Q3U213 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Serac1Q3U213 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Serac1Q3U213 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Serac1Q3U213 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Serac1Q3U213 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Serac1Q3U213 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Serac1Q3U213 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Serac1Q3U213 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Serac1Q3U213 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Serac1Q3U213 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Serac1Q3U213 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Serac1Q3U213 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Serac1Q3U213 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Serac1Q3U213 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Serac1Q3U213 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Serac1Q3U213 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Serac1Q3U213 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Serac1Q3U213 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Serac1Q3U213 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Serac1Q3U213 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Serac1Q3U213 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Serac1Q3U213 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Serac1Q3U213 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms