Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0L2

Ankrd33b, Ankyrin repeat domain-containing protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd33bQ3U0L2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ankrd33bQ3U0L2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ankrd33bQ3U0L2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ankrd33bQ3U0L2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ankrd33bQ3U0L2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ankrd33bQ3U0L2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ankrd33bQ3U0L2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ankrd33bQ3U0L2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ankrd33bQ3U0L2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ankrd33bQ3U0L2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ankrd33bQ3U0L2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ankrd33bQ3U0L2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ankrd33bQ3U0L2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ankrd33bQ3U0L2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ankrd33bQ3U0L2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ankrd33bQ3U0L2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ankrd33bQ3U0L2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ankrd33bQ3U0L2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ankrd33bQ3U0L2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ankrd33bQ3U0L2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ankrd33bQ3U0L2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ankrd33bQ3U0L2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ankrd33bQ3U0L2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ankrd33bQ3U0L2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ankrd33bQ3U0L2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ankrd33bQ3U0L2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ankrd33bQ3U0L2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ankrd33bQ3U0L2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ankrd33bQ3U0L2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ankrd33bQ3U0L2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ankrd33bQ3U0L2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ankrd33bQ3U0L2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ankrd33bQ3U0L2 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ankrd33bQ3U0L2 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ankrd33bQ3U0L2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ankrd33bQ3U0L2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ankrd33bQ3U0L2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ankrd33bQ3U0L2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ankrd33bQ3U0L2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ankrd33bQ3U0L2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ankrd33bQ3U0L2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ankrd33bQ3U0L2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ankrd33bQ3U0L2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ankrd33bQ3U0L2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ankrd33bQ3U0L2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Ankrd33bQ3U0L2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ankrd33bQ3U0L2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ankrd33bQ3U0L2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ankrd33bQ3U0L2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ankrd33bQ3U0L2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ankrd33bQ3U0L2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ankrd33bQ3U0L2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ankrd33bQ3U0L2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ankrd33bQ3U0L2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ankrd33bQ3U0L2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ankrd33bQ3U0L2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ankrd33bQ3U0L2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ankrd33bQ3U0L2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ankrd33bQ3U0L2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ankrd33bQ3U0L2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ankrd33bQ3U0L2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ankrd33bQ3U0L2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ankrd33bQ3U0L2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ankrd33bQ3U0L2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ankrd33bQ3U0L2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ankrd33bQ3U0L2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ankrd33bQ3U0L2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ankrd33bQ3U0L2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ankrd33bQ3U0L2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ankrd33bQ3U0L2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ankrd33bQ3U0L2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ankrd33bQ3U0L2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ankrd33bQ3U0L2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ankrd33bQ3U0L2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ankrd33bQ3U0L2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ankrd33bQ3U0L2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ankrd33bQ3U0L2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ankrd33bQ3U0L2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ankrd33bQ3U0L2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ankrd33bQ3U0L2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ankrd33bQ3U0L2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ankrd33bQ3U0L2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ankrd33bQ3U0L2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ankrd33bQ3U0L2 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ankrd33bQ3U0L2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ankrd33bQ3U0L2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ankrd33bQ3U0L2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ankrd33bQ3U0L2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ankrd33bQ3U0L2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ankrd33bQ3U0L2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ankrd33bQ3U0L2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ankrd33bQ3U0L2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ankrd33bQ3U0L2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ankrd33bQ3U0L2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ankrd33bQ3U0L2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ankrd33bQ3U0L2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ankrd33bQ3U0L2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ankrd33bQ3U0L2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ankrd33bQ3U0L2 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ankrd33bQ3U0L2 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms