Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hace1Q3U0D9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hace1Q3U0D9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms