Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0A6

Hbq1b, Globin d1, mousemouse

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbq1bQ3U0A6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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Hbq1bQ3U0A6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hbq1bQ3U0A6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hbq1bQ3U0A6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hbq1bQ3U0A6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hbq1bQ3U0A6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hbq1bQ3U0A6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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Hbq1bQ3U0A6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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Hbq1bQ3U0A6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hbq1bQ3U0A6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hbq1bQ3U0A6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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Hbq1bQ3U0A6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hbq1bQ3U0A6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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Hbq1bQ3U0A6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hbq1bQ3U0A6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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Hbq1bQ3U0A6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hbq1bQ3U0A6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hbq1bQ3U0A6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Hbq1bQ3U0A6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hbq1bQ3U0A6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Hbq1bQ3U0A6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Hbq1bQ3U0A6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
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Hbq1bQ3U0A6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hbq1bQ3U0A6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hbq1bQ3U0A6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Hbq1bQ3U0A6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hbq1bQ3U0A6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hbq1bQ3U0A6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hbq1bQ3U0A6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hbq1bQ3U0A6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hbq1bQ3U0A6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hbq1bQ3U0A6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hbq1bQ3U0A6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hbq1bQ3U0A6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hbq1bQ3U0A6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Hbq1bQ3U0A6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hbq1bQ3U0A6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hbq1bQ3U0A6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hbq1bQ3U0A6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hbq1bQ3U0A6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Hbq1bQ3U0A6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hbq1bQ3U0A6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hbq1bQ3U0A6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hbq1bQ3U0A6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hbq1bQ3U0A6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hbq1bQ3U0A6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hbq1bQ3U0A6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hbq1bQ3U0A6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hbq1bQ3U0A6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hbq1bQ3U0A6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hbq1bQ3U0A6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hbq1bQ3U0A6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Hbq1bQ3U0A6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms