Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXT3

Inip, SOSS complex subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InipQ3TXT3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
InipQ3TXT3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms