Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ccdc136Q3TVA9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ccdc136Q3TVA9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ccdc136Q3TVA9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ccdc136Q3TVA9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Ccdc136Q3TVA9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ccdc136Q3TVA9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ccdc136Q3TVA9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ccdc136Q3TVA9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ccdc136Q3TVA9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ccdc136Q3TVA9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ccdc136Q3TVA9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ccdc136Q3TVA9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ccdc136Q3TVA9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ccdc136Q3TVA9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ccdc136Q3TVA9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Ccdc136Q3TVA9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ccdc136Q3TVA9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ccdc136Q3TVA9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Ccdc136Q3TVA9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ccdc136Q3TVA9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ccdc136Q3TVA9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ccdc136Q3TVA9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ccdc136Q3TVA9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Ccdc136Q3TVA9 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ccdc136Q3TVA9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ccdc136Q3TVA9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ccdc136Q3TVA9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ccdc136Q3TVA9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ccdc136Q3TVA9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ccdc136Q3TVA9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ccdc136Q3TVA9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ccdc136Q3TVA9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Ccdc136Q3TVA9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ccdc136Q3TVA9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ccdc136Q3TVA9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ccdc136Q3TVA9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ccdc136Q3TVA9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ccdc136Q3TVA9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ccdc136Q3TVA9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ccdc136Q3TVA9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ccdc136Q3TVA9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ccdc136Q3TVA9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ccdc136Q3TVA9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ccdc136Q3TVA9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ccdc136Q3TVA9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ccdc136Q3TVA9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ccdc136Q3TVA9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ccdc136Q3TVA9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ccdc136Q3TVA9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ccdc136Q3TVA9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ccdc136Q3TVA9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ccdc136Q3TVA9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ccdc136Q3TVA9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ccdc136Q3TVA9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ccdc136Q3TVA9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ccdc136Q3TVA9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ccdc136Q3TVA9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ccdc136Q3TVA9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ccdc136Q3TVA9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ccdc136Q3TVA9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Ccdc136Q3TVA9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ccdc136Q3TVA9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ccdc136Q3TVA9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ccdc136Q3TVA9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ccdc136Q3TVA9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Ccdc136Q3TVA9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ccdc136Q3TVA9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ccdc136Q3TVA9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ccdc136Q3TVA9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ccdc136Q3TVA9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ccdc136Q3TVA9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ccdc136Q3TVA9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ccdc136Q3TVA9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ccdc136Q3TVA9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ccdc136Q3TVA9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Ccdc136Q3TVA9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ccdc136Q3TVA9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ccdc136Q3TVA9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ccdc136Q3TVA9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Ccdc136Q3TVA9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ccdc136Q3TVA9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ccdc136Q3TVA9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ccdc136Q3TVA9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ccdc136Q3TVA9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ccdc136Q3TVA9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ccdc136Q3TVA9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ccdc136Q3TVA9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Ccdc136Q3TVA9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ccdc136Q3TVA9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ccdc136Q3TVA9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ccdc136Q3TVA9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ccdc136Q3TVA9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Ccdc136Q3TVA9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ccdc136Q3TVA9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ccdc136Q3TVA9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ccdc136Q3TVA9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ccdc136Q3TVA9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ccdc136Q3TVA9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ccdc136Q3TVA9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms