Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trappc10Q3TLI0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms