Protein–RNA interactions for Protein: Q3TEA8

Hp1bp3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hp1bp3Q3TEA8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hp1bp3Q3TEA8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hp1bp3Q3TEA8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hp1bp3Q3TEA8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hp1bp3Q3TEA8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hp1bp3Q3TEA8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hp1bp3Q3TEA8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hp1bp3Q3TEA8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hp1bp3Q3TEA8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hp1bp3Q3TEA8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hp1bp3Q3TEA8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hp1bp3Q3TEA8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hp1bp3Q3TEA8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hp1bp3Q3TEA8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hp1bp3Q3TEA8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hp1bp3Q3TEA8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hp1bp3Q3TEA8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hp1bp3Q3TEA8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hp1bp3Q3TEA8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hp1bp3Q3TEA8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hp1bp3Q3TEA8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hp1bp3Q3TEA8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hp1bp3Q3TEA8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hp1bp3Q3TEA8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hp1bp3Q3TEA8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hp1bp3Q3TEA8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hp1bp3Q3TEA8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hp1bp3Q3TEA8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hp1bp3Q3TEA8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hp1bp3Q3TEA8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hp1bp3Q3TEA8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hp1bp3Q3TEA8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hp1bp3Q3TEA8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hp1bp3Q3TEA8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hp1bp3Q3TEA8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hp1bp3Q3TEA8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hp1bp3Q3TEA8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hp1bp3Q3TEA8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hp1bp3Q3TEA8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hp1bp3Q3TEA8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hp1bp3Q3TEA8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hp1bp3Q3TEA8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hp1bp3Q3TEA8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hp1bp3Q3TEA8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hp1bp3Q3TEA8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hp1bp3Q3TEA8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hp1bp3Q3TEA8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hp1bp3Q3TEA8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hp1bp3Q3TEA8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hp1bp3Q3TEA8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hp1bp3Q3TEA8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hp1bp3Q3TEA8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hp1bp3Q3TEA8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hp1bp3Q3TEA8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hp1bp3Q3TEA8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hp1bp3Q3TEA8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hp1bp3Q3TEA8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hp1bp3Q3TEA8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hp1bp3Q3TEA8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hp1bp3Q3TEA8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hp1bp3Q3TEA8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hp1bp3Q3TEA8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hp1bp3Q3TEA8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hp1bp3Q3TEA8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hp1bp3Q3TEA8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hp1bp3Q3TEA8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hp1bp3Q3TEA8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hp1bp3Q3TEA8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hp1bp3Q3TEA8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hp1bp3Q3TEA8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hp1bp3Q3TEA8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hp1bp3Q3TEA8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hp1bp3Q3TEA8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hp1bp3Q3TEA8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hp1bp3Q3TEA8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hp1bp3Q3TEA8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hp1bp3Q3TEA8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hp1bp3Q3TEA8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hp1bp3Q3TEA8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hp1bp3Q3TEA8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hp1bp3Q3TEA8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hp1bp3Q3TEA8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hp1bp3Q3TEA8 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hp1bp3Q3TEA8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hp1bp3Q3TEA8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hp1bp3Q3TEA8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hp1bp3Q3TEA8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hp1bp3Q3TEA8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hp1bp3Q3TEA8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hp1bp3Q3TEA8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hp1bp3Q3TEA8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hp1bp3Q3TEA8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hp1bp3Q3TEA8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hp1bp3Q3TEA8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hp1bp3Q3TEA8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hp1bp3Q3TEA8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hp1bp3Q3TEA8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hp1bp3Q3TEA8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hp1bp3Q3TEA8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hp1bp3Q3TEA8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms