Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccbe1Q3MI99 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms