Protein–RNA interactions for Protein: Q2TJ95

Rspo3, R-spondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo3Q2TJ95 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rspo3Q2TJ95 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rspo3Q2TJ95 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms