Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vax1Q2NKI2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vax1Q2NKI2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms