Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cpne9Q1RLL3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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