Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Trim71Q1PSW8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trim71Q1PSW8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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